由於政治的手伸到軍中，扁政府時代，軍隊的確颳起一股「政治風」。據指出，扁身旁能影響軍事的「五個文人」，分別是第一家庭醫師黃芳彥、前總統府副秘書長陳哲男、前中鋼董事長林文淵、前國安會秘書長邱義仁，以及前總統府秘書長陳唐山。