台南市長賴清德堅持在議長李全教司法未釐清前不進議會，4日遭監察院彈劾、移送公懲會，民進黨台南市立委參選人林俊憲質疑說，「主導彈劾案的監委包宗和，為馬英九總統的重要幕僚，曾提出『一中共表』，更是這次黑箱課綱事件裡面，課綱檢核小組的主要成員，國民黨掌控的監察院挑這樣的時機點彈劾賴市長，引發相當大的爭議」。
林俊憲表示，「馬政府藉由監院擔任打手」，企圖轉移外界反課綱焦點，；因為賴清德是全國第一個拒絕使用黑箱課綱的市長；而李全教涉及雙重賄選案，其競選總幹事日前已遭法院重判5年。
包宗和在監院記者會受訪澄清說，他是被指派調查，不是他主動調查，而且課綱和這件彈劾案兩碼子事，彈劾案正好排到現在的時間，依照程序、依法處理，沒有特別快或特別慢，完全沒有藍綠的問題。