屏東漁船赴太平島護主權，媒體報導，童振源指出，漁民不宜在未經國防部同意就強登島，因為這涉及機密及軍事管制區的規定，如果每個人都可以進入太平島，則國家的主權將蕩然無存。
童振源晚間透過新聞稿表示，他的發言是指基於國家安全的需要，太平島是軍事管制區，在沒有經過相關國防安全考量及評估下擅自進入，將對國防安全產生危害，損及國家權益。
童振源說，這是他發言的本意，並非指民眾登島會傷害國家主權，為免因為語意不夠精確造成誤會，他再次說明。
他進一步表示，太平島作為軍事管制區，代表國家對領土主權的絕對重視與捍衛的決心，政府在處理關於民間團體前往太平島的問題，完全尊重國防等單位在防務上的專業考量，而國防不分藍綠，相信國人都會理解。