梅姬颱風過境台南期間，台南安平運河一度滿溢，三爺溪溪水超過堤防，曾文水庫調節性放水每秒達4350立方公尺，疏散撤離及收容安置人數創歷年之最，這些都很罕見。
台南市37個行政區，累積雨量達豪雨、大豪雨標準，26個行政區發出淹水通報，逾5000戶人家淹水，26萬餘戶人家停電，8人受傷，農畜產損失逾億元，已要求受災農民提出申請補助。
即使到了今天，因受到低壓帶外圍環流影響，安南區少數路段積水未退，全市仍有13座橋梁及7個路段封閉。總統蔡英文昨天已到台南仁德、安南等行政區勘災，同意優先處理台南治水問題。
目前，台南還有許多地方布滿折斷的樹枝及灑落地面的樹葉，環保局也加強清運；有些人家的屋頂被強風掀開，工地圍籬倒塌，也正想法子修復重建。
高雄地區也受創嚴重，更有燕巢區發生民宅遭土石流淹沒，雖然警消和國軍全力搶救，仍造成3人罹難的憾事。
梅姬颱風遠離，解除颱風警報，高雄市長陳菊在第五次災害工作會議時表示，高雄此次受傷不輕，將全力投入災後復原工作，新生成的颱風依目前預測路徑襲台機率不低，也請團隊掌握監控。
對於部分區域仍有停電、停水，陳菊請工程人員加速復水、復電工作，並針對路樹、鐵皮或招牌等廢棄物，妥善存放及回收，另排水溝、洩水孔加速清除，避免阻塞排水。
高雄市農業損失約新台幣1.65億元，受害面積約536公頃，高雄已公告為現金救助及低利貸款地區，市府呼籲受災農民速備妥相關文件、拍照存證，盡速向區公所提出申請。