國民黨日前召開記者會，要求教育部撤換課審會研修小組召集人莊國榮；教育部表示，莊國榮主要協助法規和行政程序等，非課審會召集人，「沒有換不換掉的問題」。而莊國榮則回批國民黨搞不清楚狀況。
對此，柯志恩表示，「課審會的組成及運作辦法」攸關課審會能否秉持教育專業，且能否在公開公正的程序下訂出令師生和社會信服的課程綱要。學術界有非常多專精的學者，為何教育部委託莊國榮擔任課審會組成及運作辦法的專案研修計畫主持人，其委託依據何在？
她說，莊國榮是爭議人物，這個「黑箱決策」若不打開，恐難杜眾人悠悠之口，更不是回嗆別人「搞不清楚狀況」就能輕易交代。
柯志恩也指出，莊國榮負責研擬的「課審會組成及運作辦法」，在18日獲教育部部務會報通過，但連學生代表的遴選辦法，都是在「課程審議會學生代表遴選會議」臨時倉促決定，顯見教育部毫無準備，如此怎能讓課審會運作辦法在凌亂的討論中草率出爐？
柯志恩表示，當初課程審議被學生質疑黑箱作業，若有關「課審會組成及運作辦法」委託計畫的產生過程不清不楚、不明不白，教育部以「黑箱」解決「黑箱」，豈非更大的諷刺。