行政院發言人孫立群表示，張善政在第一時間得知消息後立即表達深切遺憾，除對罹難者表示哀悼外，也嚴正譴責暴力，並指示外交部、教育部和交通部，清查及掌握在比利時僑民、留學生和旅行團安全。
孫立群指出，比利時已將全國恐攻警戒提升至最高（第4）等級，行政院請外交部持續關注並掌握國人在比利時情形。此外，行政院也要求相關單位加強在國境入境查核和安全檢查，提高警覺並持續密切關注情勢發展。
孫立群表示，張善政已責由交通部觀光局立即掌握目前國內停留在比利時旅遊團的狀況，並隨時給予協助，必要時可洽駐歐盟兼駐比利時代表處協處。
教育部表示，目前在比利時共有90名留學生、30名交換生，但大多在距離布魯塞爾25公里外的魯汶大學，暫無傳出學生傷亡消息。教育部已緊急聯絡29名布魯塞爾地區留學生，及比利時地區台灣同學會的會長與幹部，請其密切注意緊急情況，隨時提高警覺。
交通部表示，已請各交通場站提高警覺。桃園國際機場為因應恐攻事件，已全力加強機場安全維護，以確保機場安全，第一時間已協請航空警察局加強機場航廈內外及周邊設施的巡邏檢查，並提高見警率。
交通部表示，因應反恐作業安全檢查升級，建議出國旅客較班機表訂起飛時間提早2.5小時至機場報到，以免延誤行程，並請旅客耐心配合行李安檢作業；機場公司除24小時全面加強安全監控作業外，也責成保全人員提高警戒，留意任何可疑人、事、物，並強化航廈巡邏警戒。