國防部表示，為落實公民與政治權利國際公約、經濟社會文化權利國際公約及積極回應社會大眾關注軍中人權議題，經通盤檢討國軍懲罰制度，參酌美國、英國、日本、韓國、法國及新加坡軍隊禁閉制度概況，擬具修法草案。
以往處罰士兵有關禁閉制度，受陸軍下士洪仲丘案影響，初審通過條文明定，「禁閉」都改為「悔過」。
不過，悔過室設置及悔過天數，仍待朝野協商。
另外，為周延懲罰機制，初審通過條文增列軍官「降階」及「降級」；士官「撤職」、「降階」及「檢束」與士兵「罰薪」懲罰種類，及刪除士官及士兵「管訓」懲罰，並修正現役軍人應受懲罰違失行為態樣，包括酒後駕駛、性騷擾與性霸凌經調查屬實，都列為應受懲罰範圍。
初審通過條文增列不服降階、降級、罰薪及悔過處分，得依法提起訴願、行政訴訟，並增訂悔過處分執行期間得提異議，經權責長官24小時內完成審查，認為有理由就取消處分；異議無理由，就須將當事人連同卷宗移送法院，由法院準用提審法規定處理。
行政院版草案規定被懲罰人或配偶、直系親屬及法定代理人才可提異議，但民主進步黨籍立法委員尤美女表示，指定親友可提異議，以洪仲丘案為例，軍中同袍可代提異議；會中無共識，條文保留送協商。