年底有不少節慶活動，民眾聚會狂歡也要防範各種疾病傳播。流感症狀比普通感冒來得強烈，最好的預防方法就是打疫苗。今(2024)年公費流感及新冠疫苗已於10月1日起分階段開打，11月1日將開放第2階段接種對象施打；本土登革熱新增3例，新北出現群聚情形；腸病毒處於流行期，單週就診人數略升2.1%。
疾管署規畫流感與新冠肺炎疫苗同步接種，並喊出「左流右新」口號，上路3週以來，截至10月21日止公費流感疫苗接種數約266.3萬人次，較去(2023)年同期289.7萬人次減少8%；新冠疫苗接種則高於去年，累計已有58.2萬人次，為去年同期25.9萬的2.3倍。
11月1日將開放第2階段對象接種，公費流感疫苗開放至50歲以上、公費新冠疫苗則開放全民(年滿6個月以上)施打。為鼓勵民眾踴躍接種，疾管署與全聯及地方衛生局合作，在全聯74門市及大潤發台北內湖、高雄鳳山門市設置「左流右新」接種站，並贈送前100名接種民眾健康禮。
新北市9月下旬出現本土登革熱群聚疫情，上週再增3例，分別為新北中和區1例、苗栗竹南鎮1例、新北新莊區1例。其中苗栗個案為第一型菲律賓株，與新北中和新店群聚無關；新北新莊個案為第二型，工作地與某確診個案活動地相近，與中和新店本土登革熱群聚病毒序列相同，屬於同一群聚，密切接觸者目前皆無症狀。目前新北群聚疫情已穩定下降。
而腸病毒疫情處於流行期，第42週(10/13～10/19)門急診就診共1萬6,288人次，比前一週1萬5,946人次略增2.1%。近4週以克沙奇A16型為多，其次為克沙奇A6型，不過其他克沙奇A型病毒及腸病毒D68型仍於社區活動。
根據統計，今年累計5例腸病毒感染併發重症確定病例，分別感染克沙奇A2型3例及克沙奇A10型2例，其中4例為未滿1歲幼童。疾管署發言人羅一鈞表示，今年腸病毒疫情較反常，沒有在暑假脫離流行期，且感染克沙奇A6型腸病毒後，容易引起大水泡和脫甲症，有37%的孩童染病後1、2個月出現指甲脫落狀況，隨後指甲恢復正常生長。
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