「金門 0214 事件」歷經6個月的偵查，周五（16日）金門地檢署偵查終結，對海巡執法人員均為不起訴處分，承辦檢察官客觀調查相關事證，確認海巡並無違法行事。對於海巡人員依法行政，堅守崗位維護國人權益，海委會籲請各界持續給予支持鼓勵。
海委會指出，本案因涉人員死亡，海委會第一時間即指示海巡署循傳統民俗為籌辦祭儀，早晚馨香祭拜亡者，直到上（7）月 30 日雙方簽署協商紀要，我方完成有關程序，將遺體交還陸方為止，未曾中斷；而考量三無船人員皆為經濟上弱勢，海委會同時協調關心海巡與兩岸良性互動的企業家、熱心人士捐贈遇難者家屬慰問金，展現我方人道關懷立場，給予家屬最大程度的撫慰，盼望亡者安息、生者安心。
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「金門 0214 事件」歷經6個月的偵查，今日金門地檢署偵查終結，對海巡執法人員均為不起訴處分。（金門地檢署提供）[/caption]
據檢方起訴書指出，兩船確實有發生碰撞，但無法證實漁船翻覆是因碰撞所致，因此予以海巡隊巡防艇上操作艦艇的蔡姓隊員與黃姓艇長均為不起訴處分。據檢方調查，陸籍漁船翻覆前，出現大角度地右轉，加上在碰撞前六秒，漁船突然降速，指出若海巡在6秒內反應應可避免碰撞，但六秒反應太短，難以因此歸責。
檢方並指，翻覆漁船並無船名，生還的兩名漁民證稱漁船是「黑船」，不能報關也不能下水，船長於今年1月始拿到該漁船，「出航經驗不到10次」，另外漁船設計亦屬於不安全船舶，因此認定翻覆可能出於漁船本身未具適航性。另外，海巡依法登艇稽查，本就屬於依法實施，船舶余登艇過程發生追逐、碰撞，都是「法所容許之風險」，故予以不起訴處分。
海委會對於海巡執行取締三無船過程中，不幸發生2名大陸人士死亡意外，海委會對此感到難過不捨，對於未及錄影蒐證致家屬哀痛，海巡署除多次向社會及家屬表達歉意，並全面精進執法技巧，盡最大的努力，避免類案再度發生，海委會也呼籲陸方有效管理違法船舶問題，恢復事件發生前兩岸海域之平靜！
海委會對陸方釋放胡姓釣客感到欣慰，也樂見兩岸持續堆疊善意，希望陸方在完成有關程序後，儘速釋放澎湖籍「大進滿 88」洪姓船長及漁船，恢復既有協同執法機制，合作維護海洋秩序，相互投入救生救難等工作，共創兩岸人民的最大福祉。