喬治亞·古列爾米 Giorgia Guglielmi發表在最新一期《自然》(Nature)的<大量癌症基因組如何改善兒童白血病的治療>( How a trove of cancer genomes could improve kids’ leukaemia treatment)指出，分析顯示，一種快速生長的兒童癌症有 15 種不同的亞型，每種亞型都與特定療法的反應有關。(Analysis shows that a type of fast-growing paediatric cancer has 15 distinct subtypes, each linked to responsiveness to particular therapies.)
讓一些兒童免於最嚴厲的化療方案
根據基因組分析，主要影響兒童的侵襲性血癌有15 種不同的亞型，每種亞型都與特定的結果和對藥物的反應性相關。這項工作有望改善治療——例如，讓一些兒童免於最嚴厲的化療方案，並為其他兒童提供最新的免疫療法。
研究人員表示，這種詳細的分類為標靶治療鋪平了道路，為 T 細胞急性淋巴細胞白血病(T-ALL)患者帶來了希望，約佔所有兒童癌症的 5%。今天發表在《自然》雜誌上的這項研究可能有助於預測誰不太可能對治療產生反應，並且可以指導醫生從一開始就選擇更有效的療法。
「這是一項精彩的研究，對於治療T-ALL 患者的每個人來說都是非常豐富的資源，」比利時根特佛蘭德生物技術研究所的白血病遺傳學研究員Jan Cools 說道，他沒有參與這項研究。
幹細胞變壞了
當骨髓中的突變幹細胞產生大量異常 T 細胞（一種免疫細胞）時，就會發生 T-ALL。研究的合著者、兒科腫瘤學家 David Teachey 表示，儘管隨著化療的進步，T-ALL 的生存率有所提高，但15-20% 的兒童和青少年會復發或對標準治療沒有反應的疾病形式。他說，這意味著找到更好的生物標記來預測哪些 T-ALL 患者需要標靶治療或新的治療方法非常重要。
先前的研究已經確定了 T-ALL 的各種亞型，但還沒有足夠大的研究能夠僅根據基因變化可靠地預測一個人的病程。因此，Teachey 和他的同事分析了 1,300 多名接受相同治療的 T-ALL 患者的腫瘤細胞和健康細胞的完整 DNA 序列。研究人員還檢查了細胞 RNA，以了解癌症樣本中基因活性如何改變。
連接基因組和結果
該分析發現了 15 種不同的 T-ALL 亞型，其中一些亞型以前未被表徵。每種亞型都表現出獨特的遺傳改變和基因表現模式。具有某些亞型的人在治療後更有可能殘留癌細胞，這可能導致疾病復發。研究人員發現，患有其他亞型的人更有可能無癌生存，而一種亞型更有可能導致身體其他部位罹患另一種癌症。
分析也顯示，近 60% 與 T-ALL 相關的遺傳變化發生在不產生蛋白質但會影響基因活性的 DNA 片段中。這些改變通常會導致基因的不當激活，從而導致癌症的發展。
CAR-T 細胞療法能為癌症兒童帶來希望嗎？
研究人員利用遺傳和臨床數據，根據風險等級對 T-ALL 進行分類：非常高、高、低和非常低。庫爾斯說，這種分類可能有助於醫生客製化治療方案，為高風險族群推薦更強的化療或新的免疫療法，為低風險族群推薦較不激進的治療。
該研究吸引了來自美國、加拿大、澳洲、瑞士和紐西蘭的參與者。該研究的合著者、田納西州孟菲斯市聖裘德兒童研究醫院的血液學家查爾斯·穆里根(Charles Mullighan) 表示，由於一個人的遺傳背景會影響他們對治療的反應，因此研究結果需要在不同人群中進行驗證。
該研究也強調需要分析 T-ALL 患者腫瘤細胞的整個 DNA 序列。儘管這種「全基因組定序」由於成本原因尚未普及，但 Mullighan 預計它在未來會變得更加普遍。 “像這樣的研究有力地證明了我們應該越來越多地對這些類型的白血病進行全基因組測序。”