民眾黨主席柯文哲近期捲入政治獻金流向疑雲，引發軒然大波。北檢12日主動分他字案調查是否涉及偽造文書等罪嫌，14日上午即展開大規模搜索行動。
調查局兵分多路，搜索會計師端木正的事務所、柯文哲位於台玻大樓的辦公室，以及木可行銷公關公司等地。搜索歷時約3小時，檢調人員帶走6箱資料。民眾黨副秘書長許甫表示，黨部主動提交6箱大選時期的競選經費憑證給檢方。
柯文哲14日上午9時到民眾黨中央黨部開會，下午2時離開時被問及是否覺得冤枉，他僅回應「不會啦不會啦」，並提醒媒體趕快躲雨。民眾黨原定當天由競選總幹事黃珊珊代表前往北檢控告會計師端木正，但因搜索行動而取消。
柯文哲陣營指控端木正擅自調節漏報金額約1817萬餘元至時樂、尼奧與木可等公司，且未告知競選團隊。然而，柯文哲遲遲未對此事作出明確說明，危機處理能力受到質疑。
除政治獻金案外，柯文哲還涉及京華城容積率放寬案。北檢已約談台北市前副市長彭振聲，並限制其出境、出海、住居。檢廉還約談了多名台北市都市計畫委員會審議委員。京華城案被質疑可能牽涉上百億金流利益，疑有圖利財團之嫌。
此外，柯文哲還被告發北士科及台北市萬大第一果菜及漁類批發市場案，由廉政署北部地區調查組分案調查。據了解，檢廉已陸續約談北市都發局、都更處等約30多名證人說明。
有政論人士預測，柯文哲可能面臨更嚴重的法律風險。他們認為，前北市副市長彭振聲可能掌握關鍵證據，而檢調的調查範圍可能會擴大到其他案件。