行政院副院長鄭文燦被檢方指控涉嫌，在市長任內收賄一事引發各界關注。尤其是檢調明明在今年4月己經掌握資料，卻到現在才發動逮人，引爆外界的揣測，各界直指是總統賴清德授意，前民進黨立委郭正亮指出，鄭文燦是英系代表，當初是總統候選人。而國民黨台北巿議員更指出，賴清德有四個意圖。
行政院副院長鄭文燦的涉貪案，外界感到不可思議，不過，政治圈的人並不意外，大家直指背後的指使人是總統賴清德。「館長」陳之漢在直播中表示，若賴清德不點頭，鄭文燦怎麼可能犯事？若不是林智堅論文案爆發，鄭文燦可能會成為總統候選人，因為他是英系的代表人物，藍白陣營一直在打擊他。
另外，前立委郭正亮錄影時提到，館長的看法正確。陳建仁本不應該擔任行政院長，原本內定的是鄭文燦，只是因為論文爭議，蔡英文仍然讓他擔任副院長。事實上大家都知道陳建仁只是名義上的院長，實際上資源分配的操盤者是鄭文燦。
郭正亮也指出，原本的計劃是讓鄭文燦當行政院長，再接任黨主席，最後競選總統，「這就是天意」，賴清德終究有總統命。賴清德一路被打壓的不愉快記憶及知道的一些內幕，逐漸浮現了一些人名。
另外，國民黨議員游淑慧在臉書上指出，賴清德此舉有四個意圖：打擊貪污、提高自己威望、打擊政敵、震懾觀望者。
她指出，賴清德的定調意味著鄭文燦的案件就是貪污，辦他就是肅貪。賴清德是個狠人，能在上任47天內對自己黨內要角開刀。這是賴清德精心策劃的第一步，未來三年多的任期內，他可能會走類似習近平的反貪路線，「老虎蒼蠅一起打」。
游淑慧分析，賴清德此舉不僅提高自己的威望，還能打擊不順眼的政敵及震懾觀望者。選擇鄭文燦開刀的好處有四：首先，處理鄭文燦能換取美名；其次，解決過去的宿怨；第三，通過肅貪啟動未來四年的政治整肅；最後，瓦解鄭文燦的龐大政商集團。
她進一步指出，賴清德的肅貪行動將整碗捧走，過去鄭文燦累積的人脈和資源都將瓦解，成為政治鬥爭的犧牲品。
另外，熟悉政治圈的人也說，賴清德這一把，其實也還沒有下重手，因為從交保金只有500萬元，表示是教訓多於實質，只要鄭文燦去輸誠，表達全心全意的臣服於賴清德，甘願當他的「細漢」時，應該就能小事化無，大家可以等著看。
這場政治風暴讓人看到賴清德的手段和決心。隨著鄭文燦案的進展，未來台灣政壇可能會出現更多波動，賴清德的肅貪行動也將成為各界關注的焦點。