陸軍司令部週六（6月1日）表示，5月29日有兩艘中共「登陸艇」進入金門限制水域，金門防區立即通報金門海巡隊前往應處，並通令戰備部隊加強戒備。
金門的太武山雷達站與海巡岸際雷達站於5月29日上午9點13分，監測到中共舷號“KD161”及“KD162”的“陸軍補給船”，航經台灣金門翟山南方限制水域。
媒體比對海巡署公佈的“陸軍補給船”影像指出，入侵金門限制水域的應為“玉南級改進型坦克登陸艇”，改進型比原型艇多出舷側吊臂與疑似電偵天線的結構，登陸艇原用於執行兩棲攻擊、運送車輛、部隊和輜重任務。
陸軍司令部表示，金門防區當時立即依“國軍經常戰備時期突發狀況處置規定”，通報金門海巡隊前往應處，並通令戰備部隊加強戒備；海巡署金馬澎分署則表示這兩艘船「動機不明」並持續喊話驅離，後續兩船在9時53分駛離，全程約40分鐘。
金門縣政府公告金門地區禁止限制水域範圍，是正東方轉向正南方向外緩衝1000公尺至2000公尺；餘向外緩衝300公尺。金門翟山南方限制水域則是2000公尺的範圍內。
國防部高層官員指出，金門因為位於廈門灣內，東西兩側都有中國大陸的港口，船隻往來非常密集。中國船隻從台灣限制水域的邊緣抄近路切過，其實已經有相當的時間，與航向正對台灣據守島嶼而來，兩者的威脅度差別很大。