海巡署第九海巡隊14日下午在金門北碇東方海域執行巡邏勤務時，於禁止水域線發現1艘陸籍快艇越界捕魚，立即驅離陸籍快艇，因該快艇拒檢且高速蛇行逃竄，追緝過程中不慎翻覆，船上4名人員落海，我方海巡艇雖協助搜救，不過其中2人送醫不治、另2名生還者則帶回金門海巡隊偵訊，本案是海巡署驅離陸船首起傷亡事件。
國民黨立委陳玉珍16日透露，罹難陸籍漁民分別是四川廣安、重慶人士，若家屬需要，她願協助對方循小三通到金門釐清案情。
大陸國台辦對遇難同胞及其家屬表示深切哀悼與誠摯慰問，並向台方表達強烈譴責。國台辦批評民進黨當局以各種藉口強力查扣大陸漁船，以粗暴和危險方式對待大陸漁民，是導致這起事件發生的主要原因，要求台方立即查明事件真相，確保大陸漁民人身安全，協助遇難漁民家屬妥善處理善後事宜，切實杜絕此類事件再度發生。
由漁船難事件，恐升溫成兩岸政治議題，金門區漁會為避免政治影響民生，15日在社群網站宣導，提醒我方漁民出海作業時注意安全，不要越界及從事違法情事，以保障人身安全。
海巡署副署長許靜芝則赴金門區漁會閉門會談，漁會提到擔心陸方藉機報復，已呼籲漁民近期盡量減少出海，避免擦槍走火。
許靜芝向金門縣府提出，縣府應透過管道向廈門告知，希望對岸能約束漁民違常事件，此次發生意外的無船名、無船舶證書和無船籍港登記的「三無漁船」，本來就是兩岸共同執法取締的重點項目，海巡隊是依法執行驅離攔檢。
賴清德當選後，先是諾魯斷交，邦交國帛琉被施壓，再來是片面取消M503航線，最近又發生金門翻船事件，造成2人死亡。兩岸關係學者分析，賴5月20日之前，大陸恐有更多制裁行動，而即將卸任的總統蔡英文，16日也在活動上向對岸隔空喊話，盼能恢復雙邊交流。