立法院院長投票，相較於藍綠兩黨票票堅固，民眾黨8票意外1票「無效票」。而民眾黨立委陳昭姿立即臉書發文致道歉，因投票筆印污手指污染導致被認定為廢票。但外界對這張無效票風波也議論紛紛。
資深媒體人黃揚明發文「溫馨」，標註「名副其實的染指」，問民眾黨會不會動用黨紀？但政治評論「逆風的烏鴉」卻認為，陳昭姿是故意的，因為沾到印泥的陳菁徽，和她都大力推人工生殖法放寬，而選票剛好也把游錫堃列在黃珊珊和陳菁徽之間。
成大教授李忠憲則批評，新立法院會期的第一天，立法院院長選舉，台灣民眾黨已經開始有雜音，這一群人本來就是烏合之眾，沒有什麼核心價值可言，機會主義者一定會想辦法鑽漏洞來保護自己。想不到連一天都撐不了！
是否對陳昭姿開除黨籍？黃珊珊表示，這只是一個小小的疏失，不會有黨紀處分。但網友留言四起「只是一個小小的疏失？」、「柯不是最愛講破窗理論?現在有破窗說是小疏失沒關係?是打算就破到底了是吧?」、「高人指點」、「支持阿北開除黨籍」、「烏合之眾」、「技術犯規沒逞（懲）處這黨沒格了寄綠（紀律）不存了先前規定都白練了」。
前立委邱毅認為「陳昭姿廢票風波」雖可能失誤，但為嚴明黨紀，柯文哲仍必須處理。民眾黨未來該如何調整迥異的各方意見？是更一致或趨衝突？一張廢票也撕開黨內更多矛盾。