2024年的總統大選前，大家都在為高端採購合約封存問題爭吵不休，但是，疾管署一拖百拖就是無法公布，最後推給高端仍上巿公司為由，要通過董事才能回應。終於在選後就公布高端採購合約。果然合約內容疑點重重。國民黨立委賴士葆質疑，2021年的7月19日通過EUA，就立刻更改合約訂定更嚴格的保密，是否有不可告人的資料？前立委蔡正元也開砲，第一次看到這麼爛的契約；前立委郭正亮指出，定價的部分就直接寫在合約裡面，那價格是怎麼做出來的？種種疑惑都叫人不得不懷疑高端合約有問題。有網友說，難怪選後才敢公布，就是有問題，怕影響選情，選後再公布，看你能拿我如何？
選前爭議不斷的高端疫苗採購合約，一直成為在野黨的攻擊主打，當時疾管署一直回覆，公布的權責在高端的董事會，而選後三天，疾管署臨時召開記者會公布高端採購合約，疾管署署長莊人祥表示，已接獲高端疫苗生物製劑股份有限公司來函通知，該公司經董事會決議，同意提前公開採購契約。
莊人祥也特別說明疫苗價格，1劑700元是他透過編列預算經費、採購計數去計算，這裡涵蓋國產、進口疫苗，也沒有包含冷運冷藏等價格，是相當初期的估算。而高端最初報價為950元，經過疾管署爭取，才降為881元（單劑量）與810元（多劑量）。
在合約方面，莊人祥也解釋，合約分兩次簽署，涉及5年保密條款為第二次合約簽訂，但保密條款並非針對新冠疫情，在先前2009年H1N1時就有過。之所以無法在選前公開，因為需要高端的同意，否則政府就是違約，回顧過去已經有3次去函希望提前公開合約。
疾管署公布合約後，外界感到更疑惑，問號一堆，立委賴士葆質疑，簽約前一天，高端疫苗正好通過食藥署的EUA，且通過後就馬上改合約，訂定更嚴格的保密，恐有又不可告人的資料？
疾管署吳秀梅回應，整個合約本來就是這樣，甲、乙兩方有合意制，7月18日召開專家會議後，就決定審核情形，開完會結果並不會另外通知。
而快速審查EUA一事，吳秀梅也強調，根據《藥事法》第48條之2有規定，疾管署先判斷是不是有緊急公共需求，確認後食藥署才會進行後續EUA審查，要不然就照查驗登記來審就好 。
另外，前立委蔡正元說，第一次看到這麼爛的契約，從以前在經商、在外商機構外商銀行，採購契約裡面，沒有寫任何品質的規定，像是買車子，車子的等級是什麼？都有基本的條件，他裡面都沒有，他只在附件一第七條交貨疫苗必須取得衛生福利部核發之藥品許可證或專案核准製造許可。這簡直就是在開玩笑，反問有人這樣在買東西嗎？
蔡正元表示，契約裡面沒寫要買什麼東西，所以那個『專案核准製造許可』，換句話說，如果高端品質不好你不能用契約來告他，你只能告衛福部為什麼核發這個製造許可。蔡正元質疑，該不會連買武器也是一樣，要買什麼不知道，是先等到簽約之後才決定，相當氣憤。
此外，前立委郭正亮則點出2部分是政府相信的，第一個是相信高端做出的實驗數據，第二是送到食藥署的時候，食藥署只看文件，認為衛福部都給文件了，那應該就不用查了，但這其中合約價格是根據什麼卻沒有說，令人高度懷疑。
不只立委嗆聲，就連網友也批，簡單來看，明明選前可公開合約，選前死都不公布，選後沒幾天，就立即公布，甚至還用來嗆聲台北巿長蔣萬安，這種欲蓋彌彰的狀態，只會讓人更懷疑合約有問題。