進口蛋風波愈演愈烈，農業部長陳吉仲19日晚間透過臉書宣布決定請辭，行政院長陳建仁勉予准辭。陳吉仲辭職前曾抱怨，全世界假消息最多的地方就是農業部門的假消息最多，每天得回應抹黑、不實的消息及新聞稿。在野陣營抨擊，「批評你的就是假消息、抹黑，再不然又推給對岸，但為何不先檢討自己？」
雞蛋進口專案疑雲重重，從政商結構疑雲、吸收款金流疑慮，升級到食安問題。長陳吉仲多次召開記者會都無法讓民眾釋疑。
陳吉仲曾回應外界質疑政府大撒幣，他說如果農業部不執行政策，政府不出一毛錢，難道能穩定雞蛋市場、解決黑市、解決蛋荒嗎？大撒幣「就是與事實不符」。強調農業部絕對是接受立法院的監督，每一塊錢是否帶來大眾的效益。
關於被質疑圖利特定廠商，陳吉仲指出，農業部8月底至9月初有些業者是長期做雞蛋貿易，幫國家解決問題，他反問：「現在一句話圖利廠商，哪些業者敢再幫我們？」對農業部惡意的批評「有還我們公道嗎？」
時代力量痛批，陳吉仲不是為民進黨選情犧牲的烈士，而是甩鍋數千萬顆蛋爛帳給全民面對的逃兵，要求政府說清楚，「不要以為官員下台止血，就能讓進口蛋疑雲自動消失」。將外界的質疑一律打成「假訊息」，不僅看不到絲毫反省，也看不到更多公開透明。
而陳吉仲的辭職外界解讀是民進黨內部風暴，陳是「被請辭」，不論是真也好，假也罷，執政黨都有責任解決「蛋蛋危機」演變成的「食安風暴」，更要解釋「圖利廠商弊疑案」。
藍營人士連續告發陳吉重3案，台北地檢署針對圖利超思、蛋品標示不實2起案件分「他字案」，將陳列為被告；另陳坦承5402萬顆蛋要銷毀，遭告發浪費公帑2億元瀆職一案，近日將分案。
對此，網友怒酸，「不負責大戲還沒演完」、「陳吉仲是準備高升吧」、「最會花錢的部長又要高升高官了啦」、「已經喬好升官的位置了」、「請交代清楚在下台！不是一走了之拍拍屁股」。