H5N1亞型高病原禽流感在全球蔓延，於夏季在國際上仍持續有案例發生，今年臺灣亦有零星案例，預估今年冬天發生H5N1禽流感的風險較高，動保處配合中央提前於今年9月1日起至明年3月31日止，啟動「秋冬禽流感強化防疫措施」，降低禽隻疫病發生及傳播風險。
市長黃偉哲表示，養禽業者除了配合政府防疫單位各項防疫措施之外，禽場自身的自主防疫作為也是重要關鍵。
動保處表示，該強化防疫措施，包含增加候鳥排遺、禽場與禽場外圍環境採樣監測量，並加強查核禽流感熱區清潔消毒作業及場域內禽場生物安全(尤其是防鳥設施)，同時也會針對流通於各禽場的蛋箱，增加蛋箱清潔消毒查核等措施，並持續針對本市禽流感高風險地區，包括下營區、六甲區、北門區、西港區、佳里區、官田區、後壁區、麻豆區、學甲區、鹽水區及溼地周邊，加強監測陸禽場、鴨場及鵝場採樣工作。
農業局長李建裕表示，秋冬季節為禽流感好發期，動保處今(112)年至目前為止，已查核本市895場次養禽場，輔導養禽業者落實生物安全防疫。動保處亦持續派遣防疫消毒車對全市禽場、理貨場、集籠場及候鳥棲息濕地等周邊區域道路進行噴霧消毒工作，今年迄今已消毒8,273場次，並請養禽業者同步於場內進行清潔消毒，共同降低環境中禽流感病毒。
動保處表示，正積極執行各項禽流感防疫工作，養禽業者應每日檢視自家養禽場內禽隻健康狀況，若有異常情形時，應立即通報動保處，切勿隱匿疫情造成禽流感病原擴散。