在台大的論文抄襲爭議中，前新竹市長林智堅與調查官余正煌的法律糾紛已經得到解決。林智堅曾在兩次記者會中指控，國安局前局長陳明通於2016年向余正煌提供了他的論文初稿，從而導致兩人論文雷同。余正煌對此指出，林智堅的說法並不符合事實，並以誹謗罪嫌對他提告。
▲ 前新竹市長林智堅與調查官余正煌達成和解。（圖／翻攝自 林智堅臉書）
林智堅也被調查局調查官余正煌指控侵犯著作權法及加重誹謗。然而，在台北地方法院的調解下，兩人在今年6月成功達成和解。林智堅同意向余正煌指定的公益團體捐款30萬新台幣，余正煌則撤回了他對林智堅的所有告訴。
兩人同意在此事件中不再提起刑事或民事訴訟。他們在共同聲明中表示，林智堅為他在國立台灣大學的碩士論文事件中所造成的社會紛擾感到抱歉，他對於給余正煌及其家人帶來的困擾表示遺憾。他還表示，他過去對余正煌的媒體批評不夠恰當，並期待調解後，雙方的生活可以回歸正常。
根據刑事訴訟法的規定，由於余正煌已經撤回告訴，台北地檢署已經將林智堅的案件列為不起訴。這是因為誹謗罪在台灣法律中是一種告訴乃論之罪，也就是說，只有被害人可以提起訴訟。既然雙方已達成和解並撤回告訴，檢方便不再追究此案。
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