奇怪，對於前總統馬英九訪陸，蔡政府僅由行政院長陳建仁表示，「馬英九不只是馬先生，更是卸任元首，行為舉止動見觀瞻，盼此行能維護國家尊嚴和主權」，綠營網軍只在「侍衛在中國沒配槍」、「馬英九坐中國航班去中國」等枝節問題上打轉。學者分析，馬英九登陸是「祭祖」，行程走的是南京、湖南等中華民國的歷史景點，凸顯中華民國存在的事實，綠營很難抹黑。 對於馬英九登陸，綠營網軍先是攻擊他的侍衛在中國不能配槍，有損國家尊嚴，接著又說他搭乘中國國際航空的班機前往中國。蔡政府對於馬英九登陸的反應就如前立委林濁水說的：「為什麼要為馬英九到中國大驚小怪。」 蘇偉碩醫師分析，馬英九是以「祭祖」名義申請登陸，時間點又是清明節時間，蔡政府難以非難。 另外，蘇偉碩認為，馬英九在大陸的行程也安排得很好，他沒去政治敏感度高的北京，避免與中共領導人「王見王」的尷尬，而是選擇中華民國的首都南京，去的是中山陵、總統府、南京大屠殺紀念館，都是與中華民國有關的歷史紀念景點，正好是將民進黨一軍。 民進黨拿對岸稱馬英九為「馬先生」而非「馬總統」來非難馬英九，而據蘇偉碩表示，其實民進黨早已經放棄「台獨黨綱」，像民進黨主席賴清德之前自稱是「台獨政治工作者」，在他就任民進黨主席時卻改口稱，「台灣已經是主權獨立國家，沒有另外再宣布台灣獨立的必要，中華民國和中華人民共和國主權互不隸屬」；連賴清德都認同「中華民國」。 相形之下，蘇偉碩認為，不管中共說不說，馬英九就是以「卸任中華民國總統」身份去大陸的，他在大陸走的都是中華民國的歷史路線，就是向中共凸顯中華民國存在的事實。 至於網軍攻擊的侍衛配槍問題，國安局長蔡明彥22日也針對「不配槍會不會尊嚴掃地」的問題表示，「不會」，一般卸任元首進行訪問，都會依照每一次不同狀況安排，像是前副總統連戰卸任後14次出訪，其中只有1次配槍，另一位前副總統蕭萬長則完全沒有配槍。 政治評論員施威全指出，馬英九不同於台灣政壇的統派，他任總統時幾次說出「九二共識一中各表，一中就是中華民國，沒有第二種解釋」，這話沒有統派敢講；馬英九發言立場強硬，中共曾私下表達不滿。 施威全指出，馬英九赴陸，不該只是外省人回鄉掃墓，更不該只是尋找中華民國歷史，中華民國是現代式，馬英九應該清楚表示「中華民國的未來式」；跟馬英九到大陸交流的「大九學堂」的台灣年輕人屆時更可在大陸大膽陳述。 名嘴黃暐瀚22日在節目中形容蔡總統訪美和馬前總統訪中是：「親美和中、雙英對決」。黃暐瀚指出，如果當初李登輝去日本靖國神社看他哥哥李登欽，台灣有人說「沒問題、能理解、應該體諒」的話，那現在馬英九要回父母的出生地，馬家的故鄉湖南湘潭祭祖，大家也一定不會覺得有什麼問題。 黃暐瀚認為，馬英九此行最主要的目的，就是人生第一次的返鄉祭祖，另外，他還希望兩岸學子多交流，以降低敵意、避免戰爭；12天的行程，會在對岸引起一些討論，馬英九肯定會在某些場合提到「中華民國」，論述「九二共識」；簡單的說，如果馬英九此行最終能夠證明國民黨「能避戰、有尊嚴」，對藍營就不只不扣分，甚至還有可能加分。 在馬前總統大陸行的同時，蔡總統將過境美國，並有兩場公開演講，還要見美國眾議院議長麥卡錫；黃暐瀚認為，蔡總統在美國的接待規格高低、美台關係，都是重點。黃暐瀚指出，馬英九的重點在「和中」，蔡總統的方向是「親美」，事隔11年，雙英再次對決，這次比的是「親美」vs.「和中」。