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民進黨籍的林智堅因為台大論文抄襲被撤銷學位、退選桃園市長，而他當時在台大國發所的指導教授、現任國安局長陳明通也悄悄辭任國發所教職，在16日於系所官網已經看不到陳明通的資料，不只林智堅出事，陳明通也涉嫌「量產論文」遭到調查中。
林智堅論文門事件在台大認定抄襲後，又被爆是林的助理楊玲宜代寫，而一路護航林智堅的指導教授陳明通也遭檢舉，台大正在進行學倫調查中。16日傳出，陳明通以「台海局勢嚴峻」為由，因擔任國安局長公務繁忙，無法繼續兼課，所以請辭。
台大社會科學院則表示，尚未收到陳明通的請辭公文，不過國發所的官網上，已找不到兼任教師陳明通的相關資料。
而適逢台大正在舉行第13任校長遴選程序，總共九名候選人參加，首場由台大工學院院長陳文章、台大電資學院院長張耀文打頭陣，被問及論文抄襲的時事題，他們也公開說明治校理念。
陳文章指出，人文學院教授每年通常只能指導2至3名學生，理工及電資學院則是5名學生，陳明通在台大應是「特別的案例」，指導的學生數目「多了點」。
他表示，陳明通自1995年至今，共指導173位碩博士，平均每年指導6人，掀起政治人物「學位量產機」爭議。
而另一位校長候選人、電資學院院長張耀文也說，電資院內老師，平均每年指導4、5名學生，除非特殊情況否則不會發生這種事。