新冠肺炎單日新增確診終止連3降，再度飆破8萬例，有3個縣市超過萬人，而累計染疫人數已超過200萬大關。今(31)天新增8萬705例確定病例，分別為本土8萬656例及49例境外移入；新增190例中重症及90例病故。中央流行疫情指揮中心宣布，自6月1日起實施防疫新制，包括暫停入境旅客落地採驗，全面改為唾液篩檢PCR，以及放寬中重症個案解隔離標準等。
六都新增確診個案中，新北市有1萬4,372例、台中市1萬586例、高雄市1萬380例等三都皆突破萬人，而桃園市則為7,826例、台北市6,707例、台南市6,485例，顯示疫情持續由北往南擴散。
其餘縣市分布為彰化縣4,740例、屏東縣2,960例、新竹縣2,064例、苗栗縣1,970例、新竹市1,734例、宜蘭縣1,649例、基隆市1,631例、雲林縣1,610例、南投縣1,381例、花蓮縣1,295例、嘉義縣1,146例、台東縣866例、嘉義市776例、澎湖縣263例、金門縣206例、連江縣9例。
新增190例中重症，包括中症108例、重症82例。1例兒童重症治癒出院，1歲男童5月18日出現發燒、咳嗽症狀，經醫院評估可居家照顧，隔天出現咳嗽和呼吸時有雜音及哮吼症狀，5月20日因血氧濃度低收治於加護病房治療，5天後移除呼吸器，住院8天後康復出院。
新增90例死亡個案，年齡以中高齡為主，均屬重度感染個案，86例具慢性病史，44例未接種疫苗。截至目前國內COVID-19累計確診已超200萬人至203萬2,983例，分別為本土病例201萬9,941人、境外移入1萬2,988人，病歿人數2,255例。
有專家推估，再過10天本土疫情會離開高原期，但死亡數將攀升，高峰落在6月10日、單日上看200例。疫情指揮中心指揮官陳時中回應，台灣每百萬人死亡率0.2，低於南韓2.4、日本0.6，也比新加坡、紐西蘭少，香港則高達8.3。
陳時中進一步表示，台灣每10萬人感染率為46.2%，只比日本37.3%高，低於香港、紐西蘭、新加坡；國內目前疫情穩定，與國外相比死亡率沒有比較高，確診後3天內死亡者占38%，台灣疫情走到中段，其他國家已趨緩，統計數字僅供參考。
因應國內外疫情變化，台灣機場防疫能力提升，疫情指揮中心宣布，暫停自歐洲、中東、韓國及東南亞、印度航班「落地採驗」措施。自6月1日零時起，所有自國外入境旅客，抵台時於機場採集唾液檢體進行PCR，完成採檢後，續行入境檢疫措施。
根據統計，國際機場旅客實施落地採驗141天，截至5月31日止，採驗2,500多個航班、近14.9萬人次，檢出境外移入確診逾6,200人，總陽性率約4.2％，9成5的境外移入個案被攔截。
此外，考量部分中重症個案經過適當治療後，症狀已緩解，但因Ct值不符合條件而無法轉出，影響醫院隔離或專責病房量能，因此專家會議決議修訂中重症確診個案解除隔離治療條件，並於6月1日起實施。
新制內容包括，將確診個案解隔條件區分為「非重症確診個案」及「重症確診個案」2大類；調整中度住院隔離確診個案的解除隔離治療條件，比照無症狀或輕症確診個案；重症住院隔離治療的確診個案，如退燒至少1天，且症狀緩解，符合下列其中1項條件，可解除隔離，轉出負壓隔離病房或專責病房，並進行7天自主健康管理。
上述所指條件為，1次呼吸道檢體PCR檢驗結果為陰性或Ct值≧30，或發病日或採檢日已達15天，且追蹤1次呼吸道檢體PCR的Ct值介於27至30，經感染科、胸腔科醫師或醫院評估小組綜合評估適合轉出。
大陸上海地區將在6月1日正式解封，防控措施以2至3天進行一次核酸檢測，持續更新健康狀況，出入公共場所、搭乘大眾交通工具須用手機掃「場所碼」，確認姓名、場所名、進入時間及核酸檢測結果。
日本將在6月10日開放旅遊團入境觀光，不過實驗性旅遊團卻傳出有旅客確診，其他同行3名遊客採陰後在旅館隔離。國內民眾也期待邊境解封，陳時中指出，民眾都對開放旅遊有期待，但要慎選時機，交通部目前正在做準備。