寶寶出生離開媽媽子宮的保護後，就要開始學著自己對抗環境中的細菌與病毒。此時，對於免疫系統尚未發育成熟的新生兒來說，腸道菌群將扮演教練的角色，對寶寶腸道的眾多免疫細胞進行「訓練」，開發其全部潛能，使腸道相關免疫系統更加成熟，以抑制病原體的生長，從而降低寶寶被感染的機率。