中央流行疫情指揮中心4月21日接獲華航通報，有外籍貨機機師於澳洲確診，隨即匡列2名接觸者，今(23)日檢驗結果皆為陽性確診、屬本土個案。由於3人曾一同到台北清真寺，引發國人擔憂群聚感染再起。另新增2例新冠肺炎境外移入個案，累計1,090例確診。
1名印尼籍40多歲男性貨機機師，4月20日執勤至澳洲時，出現喉嚨癢並於當地確診COVID-19。疫情指揮中心隨即調查個案在台活動史，並匡列接觸者及採檢，其中2名接觸者檢出陽性，新增2例本土個案。
其中，第1090案為印尼籍10多歲男性，是該名機師兒子，近期無出國史。4月21日匡列為居家隔離接觸者，並由衛生單位安排就醫採檢，4月22日出現喉嚨乾痛、暈眩等症狀，於今日確診、Ct值30。
第1091案為印尼籍50多歲男性，為該名機師的同事，4月4日至10日曾執勤至美國，期間無症狀，返台後於4月15日進行檢疫期滿採檢，結果為陰性；4月16日自覺有疲憊、身體微熱等症狀，同日中午與機師及第1090案一同前往台北清真寺，4月18日出現輕微咳嗽症狀，經服藥後症狀改善，因預計返回印尼探親，4月21日自費採檢後確診、Ct值27。
疫情指揮中心表示，3名個案雖有台北清真寺共同活動史，但是否為群聚事件，待進一步調查釐清。由於個案發病前2日至住院隔離前，澳洲確診機師曾到過大園清真寺、全聯蘆竹南竹店等處，提醒曾前往該地者自主健康管理14天，如有疑似症狀，應儘速戴口罩就醫，並主動告知醫師活動接觸史。
雖然台北清真寺規定進入禮拜者皆須佩戴口罩、量測體溫，但從今(2021)年2月起取消實名登記，增加疫調的困難度。將持續追蹤當天參與活動約400名信徒動向，已由環保局完成清消，且自即日起暫停禮拜至少一週。
疫情指揮中心進一步指出，已掌握58名接觸者，其中2人陽性，8人陰性，23人檢驗中，25人待採檢，接觸者持續匡列中。為求慎重，將針對華航目前處於居家檢疫及自主健康管理期間的貨機機組員，共1,270人擴大採檢。
至於5月16日由台北市府舉辦的開齋節將近，副市長黃珊珊回應，仍會籌辦開齋節，但會因應疫情配合中央指示，做機動性的調整，該停就會停。
今天新增2例境外移入，第1088案為印度籍30多歲男性，4月6日來台工作，於今日確診、Ct值32；第1089案為比利時籍40多歲男性，4月6日來台工作，4月20日出現頭痛、喉嚨痛、流鼻水及嗅味覺異常等症狀，隔日由衛生單位安排就醫採檢後確診、Ct值20。
鄰近的日韓兩國疫情再次升溫，韓國單日確診797例，刷新1月初以來新高；海軍艦艇群聚感染已有32人確診，4月26日起將對慶尚北道部分地區試行一週新防疫規範。日本政府為避免黃金週連假人潮聚集，宣布對疫情嚴峻的東京都、大阪府、兵庫縣及京都府4都府縣發布第3度「緊急事態宣言」，實施期間為4月25日到5月11日。