國內新冠肺炎疫苗即將開打，且世界各國早已施打，期望各國邊境逐漸解封。消基會比對鄰近國家和我國自費核酸檢驗的常規費用，發現國內自費採檢費用，不僅高出鄰國14倍之多，更有超過6成的醫療院所收費標準，高於衛福部所屬醫療機構訂價，而且計價方式和細節可能暗藏「黑箱作業」。
消基會統計國內醫療機構收取自費核酸檢驗常規費用，介於4,500~8,000元不等，相較香港地區採檢費用約新台幣865~5,292元、澳門地區約320元，台灣的費用分別高出5倍及14倍。而今(2021)年春節除夕到初四期間，計有2,565人出境桃園國際機場，若以每人每次5,000元計算，光是支付核酸檢測費用就高達1,282萬元。
目前全台共計110家醫療院所獲准提供自費核酸檢驗服務，消基會統計71家醫療機構，結果顯示常規檢驗(一般件)收費區間為4,500元~8,000元，報告取得時間1~2天，最慢達3天；快速檢驗要價5,500~7,300元，當天即可取得報告；至於特急件收費區間為9,600~10,000元，最快3至4小時後可取得檢驗報告。若以衛福部所屬醫療機構訂價5,000元為標準，有42家醫療機構的收費在5,800元以上，比例超過6成。
自費核酸檢驗費用結構包含掛號費、醫師診察費、採檢費及核酸試驗檢驗費用等。核酸檢驗自費價格由醫療院所訂定後，應送交各縣市政府衛生局，依照「醫療費用收費標準核定作業參考原則」，組成醫事審議委員會，經審議後才能核定，此費用難以實驗室操作成本衡量，而會有「供需」及「時效」考量。消基會認為，現階段自費採檢缺少公開詳實說明的程序，難保當中不會有黑箱作業。
消基會指出，我國在提高採購疫苗數量與提高疫苗接種率的同時，須以防疫的角度，重新評估自費核酸檢測費用的合理性，達到全民防疫、降低民眾負擔、早日恢復經濟發展的解封目標。
消基會進一步呼籲，中央流行疫情指揮中心應率先宣布調降衛福部部立醫院的自費核酸檢驗費用，並對外界說明調降目的與費用評估與核定標準；中央與地方衛生主管機關應參考目前國情，提前檢討自費核酸檢測適用範圍與收費價格，並公開核定資訊，才能取得信任及認同，完成全民抗疫目的。