為提升非現金交付比重，國內公立醫療機構積極納入信用卡適用範圍，但許多民眾發現，看病付費若選擇刷卡，必須自行負擔手續費，導致意願降低。而衛福部現在有意解決此議題，將和金管會協調，盼朝銀行吸收的方向努力。
目前像是台大醫院、台北榮總、三軍總醫院等醫學中心，民眾刷卡支付看病費用，除少數合作銀行免收手續費之外，其餘銀行信用卡依刷卡額度或合作內容不同，酌收2~50元不等手續費，引發不少民怨。
衛福部表示，提供民眾就醫時，能以刷卡繳費的機制，的確有助於便利性增加，但以多數醫院經營吃緊現況來看，負擔刷卡所衍生的手續費很有難度，但要病人自行負擔，當然也不合理。將與金管會協商，希望由銀行端吸收或降低手續費。
以長庚醫院為例，目前刷卡付醫療費用不額外收取手續費，但一年信用卡手續費支出高達7,000萬元，有些醫院也評估刷卡手續費用支出太過龐大，僅開放民眾使用刷信用卡支付全自費醫療服務，像是自費健檢、醫學美容等，只要費用含健保項目，一律只能現金支付或金融卡轉帳。
衛福部指出，民眾於一般店家消費與醫療費用其實有差異，前者營業成本、營業稅等皆已涵蓋在售價當中，但醫療費是依據健保點值規定，因此無法與一般消費一概而論。
對於此議題，金管會也提到，其實非所有銀行信用卡在醫院消費都會收手續費，目前適用31家銀行中，包括兆豐銀、星展銀、台北富邦、華南銀、陽信銀、大眾銀、華泰銀、三信銀、日盛銀都不收手續費。
而醫院接受信用卡付款，是透過去(105)年建置的「公務機關信用卡繳費平台」。金管會認為，此平台開放各銀行自行決定是否加入，而會向持卡人收手續費，應該是基於「使用者付費」原則，之後等衛福部來溝通時，將再協商討論。