蔡英文政府上台後，兩岸關係轉趨冷淡，現在更傳出金融合作大幅降溫，國銀西進登陸申設據點的申請案，從去(2016)年520以來皆無法通過。但金管會否認此說法，強調兩岸金融往來仍維持正常，雙方金融監理及溝通十分順暢，且中國銀監會於新政府上任後，已核准4家國銀申設分支機構。
事實上，自去年520後，中國銀監會的確先後核准臺灣銀行福州分行、中國信託銀行廈門分行、國泰世華深圳分行，以及合作金庫的長沙分行等申設案，而這4家分行目前都已在中國開業營運。在子行方面，彰化銀行計畫在南京設置子行，4月5日大陸銀監會已經受理申請。至於第一銀行原本積極申請大陸村鎮銀行，但受制於服貿協訂尚未簽署，目前無法有進度。
金管會表示，國銀去年520後，確實沒有再提出到大陸設立分支機構的案子，探究原因，主要是業者海外布局的綜合性考量，在呼應新南向政策下，近期多數規畫申設東南亞分行。而任何海外分行的申設，都須循序漸進，對於業者的發展策略規畫，皆予以尊重。
金管會指出，目前兩岸金融往來仍維持正常，雙方金融監理及溝通也都十分順暢。尤其大陸銀監會主席郭樹清今(2017)年上任時，主委李瑞倉去函道賀，郭樹清也透過銀監會窗口致謝。
從金管會統計資料顯示，去年國銀的大陸分行，全年獲利僅6.3億元，年衰退幅度高達68%。反觀東南亞分行盈餘則有80億元，年增幅9.5%。國銀業者坦言，現在西進布局的意願較低，主要是對岸經濟情勢趨緩，又有人民幣匯損等因素，反而轉向去東南亞發展，不僅前景較佳，獲利機會相對較多。