陸委會9日表示，世界衛生組織是非政治性組織，近年邀請我以觀察員身分參加世界衛生大會，是出於台灣對全球防疫及衛生安全的重大專業貢獻，以及維護台灣2,300萬人民的健康安全權益，這也是基於守護全球每一個人健康的世衛組織宗旨，以及衛生防疫無疆界的世衛核心理念。
陸委會指出，台灣參與世界衛生大會，完全符合世衛組織規章，也受到各國高度支持，並「已形成慣例」，但仍遭中國大陸強力阻撓。陸委會發言人邱垂正說：『(原音)今年中國大陸以其片面宣稱的政治理由，施壓世衛組織，阻止我參加WHA，對於這種違背世衛組織宗旨，打壓我政府，無視台灣人民的基本權益，我們表達強烈的不滿、抗議與遺憾。』
陸委會強調，北京當局已連續阻撓台灣參加國際民航組織(ICAO)、世衛組織等國際組織，打壓台灣爭取參與國際組織及活動的基本權利，意圖藉此施壓我政府，達到其政治目的，「我們絶不會屈服於北京的壓力」，也會持續向國際發聲，爭取台灣參與國際組織的權益，因為台灣人民的聲音是我政府的後盾。邱垂正說：『(原音)若對岸無視我方呼籲及嚴肅的提醒，則勢必嚴重傷害台灣人民感情，激起台灣民意的強烈反彈，甚至可能讓兩岸關係漸行漸遠。』
陸委會再度呼籲，台灣民意不可輕侮，北京當局應審慎思考，堅持不讓台灣參加世界衛生大會及持續打壓台灣國際空間的可能嚴重後果，切勿因為僵化、對抗的政策思維和做法，造成兩岸關係不可回復的巨大傷害。