每年冬季候鳥遷徒，台灣養禽業者就得備戰，防範禽流感，因此政府近幾年加強推動密閉式或非開放式的飼養方式，只是成效並不好。農委會防檢局長黃黃㯖昌5日指出，去年底已加強輔導稽查，但業者幾十年的飼養習慣很難改變，目前已經開罰96場。
行政院長林全在主持「禽流感中央災害應變中心」第5次會議時也指出，政府為了養禽業者的生計，不可能一下子全面禁絕露天的飼養方式，但仍希望逐步輔導業者，逐漸轉型為密閉式養殖，以減少防疫漏洞。林全說：『(原音)一時之間為了養禽業者的生計，我們也不可能完全禁絕，如何協助他們，減少曝露在禽流感風險的機率，以及如何輔導讓他有比較好的防護，照顧家禽的方式，我們都可以再來研議，希望盡可能讓他們轉型，慢慢轉到密閉式的養殖，在防疫減少漏洞，也能減少我們的負擔。』
另外，為降低H5N2以及H5N8本土禽流感疫情，農委會也表示，未來將會加強理貨場的移動性污染防治，並輔導改善家禽產業的產銷模式，避免蛋雞場老、中、青三代不同年齡雞隻混養，縮短土雞雞隻的出清時間。