依照台大內規，校長續任由校務會議投票決議，因此楊泮池必須「請求」校務會議同意不續任。楊泮池近日在公開場合，多次表態自己辭意堅定，並呼籲校務會議代表同意不續任案，以利展開校長遴選程序。
楊泮池於2013年擔任台大校長，去年5月校務會議高票通過續任案，第二任任期為2017年7月到2021年6月。
然而，台大教授郭明良等人違反學術倫理，有論文掛共同作者的校長楊泮池受到許多責難。儘管特別委員會和教評會都認定楊泮池未違反學術倫理，他仍於3月18日的校務會議上，正式請求今年6月任期屆滿後，不再續任校長職位。
楊泮池當時強調，台大在論文案中不斷受到傷害，他很不忍心，為了不讓台大繼續受到誤解和攻擊，以及整個台灣學術界的和諧，在教評會完成審議後的第一次校務會議，是他承擔的時機。
楊泮池日前受訪時也解釋，早在去年11月論文案爆發時，就動了不續任的念頭。但擔心提早有所動作，會被外界誤解為「畏罪請辭」，所以等到教評會確定他沒有違反學術倫理後，才正式請求不續任。
對於楊泮池提出不續任，外界反應不一，全國教師工會總聯合會（全教總）發出聲明，認為楊泮池是「不續任」而非辭職，沒為真正負責，只要還擔任台大校長一天，就能運用職權和影響力遮掩外界對論文案的質疑。作家陳芳明也在個人臉書上評論，「這不是請辭，而是遁逃。」
不過也傳出海內外台大校友動員，陸續寄信給校務會議代表，希望能慰留楊泮池。紐約區台大校友便發起連署，認為楊泮池是公認的「好校長」，遭受論文風波的無理中傷，主張尊重特別委員會的結論。
特別委員會由台大邀請海內外倫理專家組成，2月23日的報告中，以6比0的票數（校內委員迴避），認定楊泮池沒有理由需辭職（There is no reason why Dr.Yang should resign）。