台經院院長林建甫致詞時表示，南台灣專案辦公室的成立為台經院成立40周年最重要的里程碑，也象徵著台經院將持續背負著國家社會發展為己任，繼往開來的決心。南台辦選擇在高雄設置，除了地理位置更接近東南亞外，另一個原因就是，高雄市已被蔡英文總統指名為「新南向基地」，台經院為國內第一個響應中央政策的智庫。另外也希望帶動國內優秀之人才先行南向，協助南部地方政府經建發展以及藉由APEC平台躍上國際舞台，以連結東南亞市場。
台經院南台辦擁有「東協暨南亞地區發展研究」、「地方產業群聚發展研究」、「南台灣新興產業發展研究」、「APEC中小企業議題研究」等研究核心能力，未來能直接地與南部地方政府研擬相關政策與議題，為政策制定者及公眾提供資訊，以決定公共政策議題的走向；地方政府扮演著國家政策最重要的執行角色，透過智庫盡可能地納入團體與個人的意見以凝聚共識，使公共政策得以滿足社會最大福利。