高雄地院指出，邱毅已盡向證人吳益政等人查證後，才在電視媒體發表言論內容，查證義務程度已符法律要求；若認邱毅查證至此，仍不得發表此言論，毋寧過度限縮言論自由的保障，恐造成寒蟬效應，造成言論市場貧乏、空洞。
合議庭表示，邱毅既經合理查證，並無實質惡意，尚難認有何散布謠言或傳播不實之事，而構成誹謗或違反選罷法之罪，因此，依罪證不足判邱毅無罪。
陳菊向檢方控訴指邱毅明知她是民國99年高雄縣市合併後第一屆高雄市長選舉候選人，意圖使人不當選，利用「凡那比」颱風造成淹水，散布謠言或傳播不實情事。
邱毅也被控在報紙刊登「九月十九日，凡那比颱風當天下午，有誰看到陳菊市長出現在高雄縣田寮？請儘速跟我聯絡，若查證屬實，並願攜同人證或攜帶具體物證者，本人邱毅願意酬謝新台幣一千萬元整。」的懸賞廣告，使人誤認她於風災當日在田寮；另以言語影射她風災當天有到田寮某溫泉會館泡冷泉，涉嫌違反選罷法及誹謗罪。
高雄地檢署偵結認為邱毅是就可受公評事項發表言論，內容也非全無依據，依罪嫌不足不起訴。陳菊不服聲請再議兩次調查。雄檢104年6月偵結認定，邱毅未善盡合理查證，依違反選罷法起訴。
高雄地方法院歷時近兩年審理，今天宣判，認定邱毅主觀上並無誹謗陳菊名譽，意圖使她不當選而傳播不實的故意，不具實質惡意，也查無其他積極事證邱毅有檢方所指犯行，判邱毅無罪，全案可上訴。
對於高雄地方法院這項判決結果，高雄市政府新聞局長丁允恭表示，一定請檢察官上訴。