李明哲遭大陸關押，他的妻子李凈瑜的援救行動引發國內外關注，社會也好奇陸委會及法務部提供哪些協助。
出席立法院朝野協商的陸委會副主委邱垂正在會中表示，在李明哲關押的這段期間，陸委會持續跟家屬保持聯繫，但包含「案情了解」、「早日釋放」、「公布關押地點」等訴求，都取決於對岸態度，儘管如此，陸委會還是透過電話、書函等方式，呼籲對岸要依循既有通報機制說明細節。
邱垂正也說，李明哲的個人藥品不僅已經送到海協會，海基會也有義務律師、相關人員全力協助家屬。邱垂正說：『(原音)有關藥品已經寄達到海協會代收請他們代轉，律師部分，海基會也有義務律師協處，家屬也一度要聘請中國大陸律師，我們也在協助行政上面的配合等等。』
法務部次長蔡碧仲在協商時也說，案件發生後，法務部就透過既有的「兩岸共同打擊犯罪及司法互助協議」展開溝通，但問題在對方遲遲還沒回應。蔡碧仲說：『(原音)我們完全遵照「兩岸共同打擊犯罪及司法互助協議」在行事，而對岸並不是如此，已經20幾天，我們到今天還不知道李明哲到底是被用什麼樣的法律機制把他關押。』
蔡碧仲表示，法務部在這起案件上，一開始有用電話與對岸進行聯繫，雖然一度有回應，但後續公函就沒有音訊。