◎學者：國內留鳥仍有H5N6病毒
家禽禁運、禁宰令解除首日，24日就傳出確診2個H5N6新案例。根據農委會至3月1日的統計，總計今年迄今，台灣禽場確診高病原性禽流感案例包括H5N2、H5N6以及H5N8共61場，已完成撲殺家禽超過44萬隻。至於具禽傳人風險的H5N6，在24日禁運宰令解除後第一天，再增加2場外，都沒有新增個案，一直維持確診禽場共11場。
中央研究院生醫所兼任研究員何美鄉指出，目前在台灣的留鳥體內一定仍有H5N6病毒，但國內飼養500隻以下的禽場不用登記，是防疫漏洞，建議農委會推動各縣市就地屠宰，病毒才不會隨著運送到處散布。
◎學者建議 農委會防疫要有分區概念
台灣大學獸醫系名譽教授賴秀穗指出，要清除一個病毒並不容易，像是連肉眼可以看到的外來種入侵植物「小花蔓澤蘭」，至今都無法清除。他也斷言，目前看來禽場間的疫情已經控制，但病毒可能還留在某些野鳥或是未發病的家禽身上。賴秀穗說：『(原音)禽場的H5N6應該是差不多了，可能已經控制了或是沒有了，但是有些鴨子感染，沒有發病，但是禽場裏面H5N6沒有，不代表病毒沒有在台灣，可能還在野鳥或是留鳥裏面，也可能感染一些家禽，像一些鴨子，它可能不發病，今天如果我們把禽場的H5N6控制，不代表病毒已離開台灣，所以監測也就非常重要，以及對於禽場的教育很重要。』
台大流行病學與預防醫學研究教授金傳春指出，以目前台灣國內有些縣市同時存在H5N6、H5N2，不同型的禽流感病毒如果同時存在，基因很容易重組，且有些縣市同時存在H5N6、H5N2，又分別感染不同禽類，這些都是高風險區，農委會在防疫上，應該要有分區的概念。金傳春說：『(原音)如果H5N6在某個地區已經有比較多種種類，H5N2也比較多，這要比較謹慎，我們也清楚，如果是小農養得很少，就很難偵測。』
◎禁令措施防疫奏效？ 農委會：要觀察至5月底
面對在台灣首次出現的H5N6高病原禽流感疫情，農政單位在第一時間施鐵腕，祭出家禽禁運宰令，但禁令措施是否奏效，農委會主委林聰賢表示，得要觀察至5月底。農委會副主委黃金城進一步指出，由於每年的3至4月，候鳥會北返，北返以後台灣國內家禽帶毒的狀況就會消失，至於排出來的病毒，大概會維持3至4個星期，所以待環境中的病毒都死掉，且都沒有再傳出案例，才可以說台灣對H5N6的防疫成功。黃金城說：『(原音)譬如野鴨，如果帶有病毒，北返環境就沒有了，我們知道目前就是鴨帶有病毒，沒有症狀，所以大概3至4月等他們北返，環境裏面的病毒已經死掉了，才可以說確定是已經控制得差不多了。』
2015年台灣爆發禽流感，當時撲殺超過千場、500多萬隻家禽，禽流感疫防確實不能大意。儘管行政院長林全對於農委會和相關部會，在這一波禽流感防疫給予嘉許，但也強調3月份天氣寒冷，仍屬禽流感好發時間，他也進一步指示農委會與衛福部著手研議成立「國家專責流感防控中心」，進行流行病學研究與疾病防制管控標準作業的研訂，將禽流感當作常態性的防疫作為。