農委會宣布17日凌晨零時起先禁運，同日中午12時起禁宰，都各執行7天。
農委會防檢局及衛福部家衛所都強調，人畜共通的H5N6高病原性禽流感病毒在啟動階段時必須堵住它的發展，不能向上攀高峰，否則病毒轉變成禽傳人及人傳人的流感時，就難以控制，因此在疫情發生先期，就施行全國家禽禁運禁宰7天，以徹底防疫、清除病毒。
不過防檢局監控顯示，到2016年7月之後也沒有白肉雞場感染禽流感疫情，另蛋孵化28天在攝氏38度環境下，病毒已殺死；所以白肉雞及蛋不在禁運禁宰之列。
但是記者走訪南門市場，販售白肉雞雞腿的攤商抱怨指指出，進價原本每台斤就要100多元了，措施上路首日批貨竟又貴了5元，質疑有官商勾結的情事發生。
便當業者受訪時則指出，白肉雞進貨價，15日每台斤50元，16日53元，17日措施上路，18日再漲為54元，並預告20日還要再漲，深感不合理，希望政府介入調查。
農委會畜牧處副處長王忠恕表示，生意人總會在這時候想漲一點，但畜牧處呼籲中盤商不要漲價，禁運禁宰是短期措施，到時候土雞恢復屠宰上市，雞價就會回跌了。農委會副主委黃金城強調，連續漲不應該，會聯繫公平會調查。1060219