司法改革分為3個階段，在經過第一階段意見徵集後，即將在20日進入第二階段分組會議。
司法改革國是會議籌備委員會副執行秘書林峯正2日表示，籌委會已將上千則意見歸納出所涉問題清單及20個主要議題，在分組會議時將分5組討論。林峯正：『(原音)這5組會議要討論以這20個議題為基礎，分組會議從2月20日預計會開始展開，為期大概3個月，每個分組每2個禮拜會開1次會議，3個月的時間，每個分組目前規劃要開6次會議，不過因為每個分組的議題難易不同，有些議題也許需要再多加開會議。』
這5個分組將鎖定人權、信賴、效率、友善及安全5大領域，分別是「建立保護被害人與弱勢者的司法體制」、「建立全民信賴、公正專業的司法體制」、「建立權責相符、高效率的司法體制」、「建立參與、透明、親近的司法體制」、「建立維護社會安全的司法體制」。分組會議成員共75人，包括10名法官、10名檢察官、10名律師、5名法學者以及40名、超過一半的非法律人代表。除了所有籌備委員有權力推薦分組委員外，籌委會也已在年前發函給曾在意見徵集階段曾向總統府具體表達司改意見的41個團體，請他們推薦特定委員供籌委會討論。
籌委會預計在13日召開第四次籌備委員會，屆時將公布分組會議的委員名單及議題清單。