為了避免台灣與澳門航空企業被雙重課稅，陸委會授權「澳門事務處」與「澳門經濟文化辦事處」在去年12月簽署「台灣與澳門避免航空企業雙重課稅協議」，由於涉及國民權利義務，必須比照「條約締結法」的規定送交國會審議。
因為第八屆立委會期沒有處理此案，於是接續在第九屆會期提出審議，不過，會議一開始，國民黨立委黃昭順就提出質疑，認為應該等「兩岸協議監督條例」立法完成後，才能處理這項協議案。黃昭順說：『(原音)民進黨過去都主張一定要先立法再審查，我們現在這主張還在嗎？如果還在，今天這樣排就不對，應該把那個協商處理完再排審才對，怎麼會今天排審？』
不過，現場多數立委還是支持審查議案，因此，黃昭順的質疑並沒有影響會議進行。陸委會主委張小月在答復民進黨立委李俊俋時也說，這項協議適用「香港澳門關係條例」，跟「兩岸人民關係條例」沒有關係。李俊俋說：『(原音)今天談的是港澳條例，這是去年就跟澳門簽的協議。第一個，這不是兩岸關係，所以跟「兩岸人民關係條例無關」。(張：是的，的確。)其實這跟「兩岸協議監督條例」也沒有關係，因為「兩岸協議監督條例」是國會如何監督行政部門如何訂協議的問題。』
最後朝野順利完成初審，同時通過附帶決議，要求陸委會未來每季都要提出書面報告、每半年要到國會進行專案報告。
根據陸委會的資料，相關協議有助於空運業者發展市場，也能優化台灣的投資環境；財政部也在報告中指出，這項協議可以促進台灣與澳門的經貿往來，帶動國家的經濟發展。