包括國民黨等多個團體一早就動員到公聽會外包圍，並幾度欲衝入會場，與警察爆發激烈推擠衝突。
場內也有多名民眾在公聽會開始前便高聲抗議，要求開放場外民眾進場聆聽，先處理程序問題，並質問上次的會議紀錄在哪裡，會議議程因此延遲。
公聽會由台灣動物社會研究會執行長朱增宏主持，針對六大爭點，由NGO、專家、民眾、民代政黨、政府、連江縣及網路等代表發表意見。
六大爭點包括政策要從地區管制轉變為風險管制是否合理？政府是否掌握足夠且可信賴之資訊與報告(含產地之環境監控等)？調整進口日本核災區鄰近縣市食品，是否與國際貿易談判有關？政府對於進口食品管制的方法、檢驗技術與量能，能否為食安把關？政府對市場消費端的管理是否已經到位？人民可以信賴政府的「把關」嗎？
這場公聽會也透過網路現場直播及文字直播，所以民眾都可上網觀看並提出意見與疑問，包括衛福部、經濟部、農委會、外交部、原能會、財政部等所有相關部會都派代表在網路上即時回應。