本次慰助金來源為加拿大基督長老教會11月初甫捐入的16萬美元以及日本政府捐新台幣397.8萬元。南台地震發生至今,紅十字會總計發出慰問金8,200萬7,217元,受益人次達1,575人。
此外,紅十字會運用0206南台地震善款協助屏東、高雄、臺南及嘉義等5縣市24所偏鄉國中小及高中校舍及設施修繕補強,另協助臺南市3所學校更新教學設備,合計金額近8,700萬元新台幣,除台南市北門國小玉湖分校可望於年底完工,台南市學甲國中、北門國小、嘉義縣溪口國小、高雄市金竹國小4處工程將於明年1月完工,其餘20所學校皆已完工。