桃園機場未來10年將進行一連串航廈及跑道整修工程，包括現在的二航廈、未來的第三航廈、第三跑道以及衛星廊廳等，都需百分之百自行籌措經費，總金額高達新台幣1,735億元。
為此，立法委員陳歐珀8日在立法院交通委員會指出，桃機公司為了籌措經費，研擬調漲航機費，項目包括降落費、停留費、空橋使用費等，部分費率漲幅達2成。此舉已遭外界質疑，違反國際民航組織ICAO透明化的原則。陳歐珀說：『(原音)國際航空協會IATA跟台北市航空商業同業公會都質疑，桃機沒有依照ICAO國際民航組織的透明化做處理。而且當時桃機公司給這些業者的承諾是4年，結果你們開董事會，又改變成2年，這樣是沒有誠信的喔！』
對此，曾大仁保證，所有協商過程，由桃機各航空公司組成的「航聯會」都有參加，絕對符合透明原則；至於緩衝期也是參考其他國家航空機場的做法。並強調，即使部分項目收費調漲，但相較東亞其他國家，桃機的收費仍是最便宜的。曾大仁說：『(原音)我們比其他國家的國際機場還是便宜，在東亞地區我們是最便宜的。』
曾大仁也表示，目前調整的航機費率已呈報交通部，待交通部核定後就會實施。不過陳歐珀仍要求交通部核准前，要對外做充分的說明。