台南市生態保育學會理事長邱仁武今天表示，昨天接獲沿海地區漁民反映，11月初以來，發現水利局等單位雇工以黑色柏油或油漆等，噴在白鐵製的水閘門上。許多油脂流入溪水中，尤其北門地區還在北門濕地範圍內，生態相當豐富；有的地區還鄰近捕鰻魚苗區，影響水源及污染生態。
邱仁武指出，許多漁民擔憂為了防止水閘門被偷，反而影響生態保育及水源，希望有關單位重視。
台南市政府水利局回應指出，因治水工程的推展，台南市水閘門數量從民國99年的630扇，至今年已成長到3047扇。但水閘門多屬不銹鋼材質，容易被偷；市府102年起試行在水門塗上柏油漆，增加竊賊銷贓困難，也達到加強防鏽效果。
水利局指出，試辦結果於102年只被竊2扇；103年擴大實施後，至今都還沒有傳出遭竊，失竊問題已明顯改善。市府今年預計於北門、將軍、安南等沿海地區再塗上250扇。
水利局指出，近日北門區2至3處水門傳出柏油滴落水面導致水面污染情況；檢討後發現是外包廠商人員在柏油內添加過多有機溶劑，導致油漆流動性過大。加上漲潮時水門碰觸水面，導致部分油漆溶出而發生汙染。當天廠商已發現，隔日重新調配柏油，沒有再發生汙染情形。
水利局指出，現已暫停施作上漆作業，將檢討作業的標準程序，加強包商管理。並準備吸油棉或墊襯帆布等防治污染設備；針對施工人員再進行教育訓練後，再恢復施工。