馮明珠卸任後獲聘北京故宮顧問引發爭議，除馮明珠自行簽核，將故宮退職政務官赴大陸管制年限從3年先修改為1年，又在今年5月20日前再修改為3個月，有違利益迴避原則；另外則是擔任北京故宮顧問是否涉及洩漏機密。
立法院教育及文化委員會16日審查故宮預算，國民黨立委陳學聖在會中指出，陸委會副主委邱垂正私下拜訪他時曾提到，馮明珠擔任北京故宮研究院顧問沒有違法。陳學聖認為，若馮明珠沒違法，故宮要還她清白。
行政院大陸委員會副主任委員兼發言人邱垂正今天在例行記者會上表示，依兩岸人民關係條例第33條規定，台灣人民不得擔任中國大陸黨務、軍事、行政機關或行政機構的職務。
他說，兩岸條例第33條所稱職務，依陸委會函釋，不包括榮譽性質名銜。至於是否屬榮譽性質，應具體判斷該職務是否屬名譽性、非常態性、兼任性及有無固定薪資等標準綜合認定。
邱垂正強調，關於馮明珠擔任中國大陸「北京故宮研究院」顧問案，是否構成擔任職務，必須審酌前述標準綜合認定。整起案件目前由故宮確認中，陸委會將盡速邀集相關機關協助研商處理。
邱垂正重申，自己當時並未向陳學聖提出馮明珠是否違法的相關論述，針對馮明珠是否違法，仍須由主管機關進行行政方面確認。