政權輪替後，文化總會會長人事引發關注，由於幾天前文化總會突然收到兩批共600多人要申請加入會員，中華文化總會副秘書長丁乃琪說，「一下湧入這麼多，有點不尋常」。
中華文化總會長劉兆玄會後也發表「裸退」聲明，他表示，這是他卸任之前以會長身分所舉辦的最後一次執行委員會議，下一次就是會員大會，屆時也將改選會長、執委、諮委，並且討論這600多人是否可入會。
總統府發言人黃重諺今天受訪指出，文化總會一直以來毫無疑問就是以國家資源投入創設，由歷任總統擔任會長並主導運作的法人單位，慣例上也都隨著政黨輪替而交接。若有媒體所報導可能淪入私有的狀況，相信不會為國人所樂見。
另外，黨政人士透露，前總統馬英九當年拋棄慣例，把會長交給劉兆玄，就曾經被質疑有私相授受，國家資源淪為私人的問題。這次劉兆玄等人操作執委會流會、拒絕新會員，相關的質疑等於不證自明。
黨政人士說，「不論劉兆玄是否裸退，這是公產變私產的問題。如果2008年阿扁和陳郁秀也這樣做，國民黨會接受嗎？」另外，黨政高層指出，劉兆玄卸任後，預料蔡總統將依循「總統擔任會長」慣例，親自出任文化總會會長。