市府農業局指出，南市轄內重要濕地有8處，2處國際級（曾文溪口及四草），6處國家級（八掌溪口、北門、七股鹽田、鹽水溪口、嘉南埤圳及官田）。依據104年1月28日公告確認範圍，南市轄內重要濕地總面積1萬0331公頃，86%為公有地，其中曾文溪口、四草及七股鹽田重要濕地均為公有地。私有地大部分為台糖公司及嘉南農田水利會所有，少部分位於行水區內。
農業局長許漢卿報告指出，濕地保育法於去年二月二日發布實施，台南市共有八處重要濕地。重要濕地範圍內原合法從事的農業、漁業及建物等，均可依原來現況使用，不受影響。
市議員陳朝來指出，政府要劃濕地，完全未跟地方居民溝通，說劃就劃，先前在永華市政中心舉辦的說明會，也沒有人前往參加，僅在場員警簽名出席，根本是造假矇混。七股鹽田過去都是民地被強徵，鹽田停採也沒還給原有地主，現在卻變成濕地，漁民從事漁撈行為動輒被開罰，加上工廠排放廢水也不符合濕地規定，地方發展受到限制；在未經居民同意下，根本不符拉姆薩濕地公約的精神。
市議員蔡育輝、李文正、莊玉珠等人認為，濕地劃設，保護環境是好事，但不應該影響原有漁民的生活及生存，一千多公頃農地被劃入濕地，在無配套措施情況下，叫漁民何去何從？
許漢卿表示，濕地法主要是確保天然滯洪功能，且可淨化水質，由於濕地是眾多生物棲息、覓食的環境，也可增加海洋中的魚群量，維持沿海地區殖漁業的經營，增加漁民收益，但濕地劃設難免對漁民造成不方便和限制，目前市府還在和中央溝通。