行政院推動組織改造，蒙藏委員會的裁撤被列為優先處理部分。
立法院內政委員會2日安排蒙藏委員會委員長林美珠報告業務概況，對於蒙藏委員會的裁撤，林美珠會前受訪時表示，她採取開放態度，「是可以同意的」。她指出，以目前蒙藏委員會的人力、預算與功能性，不太能夠承擔起一個部會，要裁撤或整併，一切配合行政院的政策。她說：『(原音)因為從我們蒙藏委員會現在的整個人力跟預算或者是功能性來講，要承擔起一個部會，坦白講，是不太夠的，因此我的態度是採取開放，也就是說如果要裁或是併，我是可以同意的，但是這整個大政策還是要配合行政院，所以就配合行政院整個組織再造的行程，我們可以再來考慮的。』
林美珠說，蒙藏委員會的同仁都非常積極協助處理國內蒙族與藏族同胞的問題，包括醫療、文化、弱勢照顧、就醫、就學等。她強調，蒙藏委員會的預算的確有逐年減少，但委員會照顧蒙藏同胞的精神不變，未來即便裁撤，相關業務也須由其他部會承擔，因此預算不可能大幅刪減。
林美珠在業務報告時指出，蒙藏委員會現階段的工作是促進台灣與蒙族聚居地區、尤其是蒙古國的經貿交流，像是推動「台灣與蒙古國高科技重點稀貴金屬來源掌握專案計畫」，並加強在台藏胞的輔導照顧，協助解決在台藏族人士居留及歸化問題。