外交部亞東關係協會副祕書長周學佑1日在例行記者會上表示，第一屆「台日海洋事務合作對話會議」是首次專就整體海洋議題，並以合作為導向所舉行的協商會議，雙方在互惠互利的基礎上架設溝通平台，成功創建長期、全面的制度化協商機制，會議本身對台日關係而言，「具有重要的象徵意義」。
至於各界關注的「沖之鳥」經濟海域爭議以及台灣漁民的捕魚權益問題，周學佑指出，「沖之鳥」主權屬於日本，國際間並無爭議，「沖之鳥」議題的重點在於附近海域的國際法地位，而國際法地位並非台灣所能片面決定，即使我方片面宣布，「也無法確保台灣漁民權益」，周學佑說：『(原音)在沖之鳥法律地位未有定論之前，日方不得主張200海里專屬經濟海域，這是我方一貫的立場，我們已多次向日方抗議扣捕我漁船，政府對於維護漁民權益的立場是不會改變的。』
周學佑表示，我方有在會議上明確向日方表達上述立場，只是雙方對此仍各持己見，因此，面對外界認為這場會議是在各說各話等質疑，周學佑則是希望各界注意「建立平台」及「合作」這兩個面向。