新華社報導，神舟十一號上午7時30分從甘肅酒泉衛星發射中心升空。成功入軌後，控制權就交到北京航天飛行控制中心。太空船在軌飛行期間，中心科技人員要對太空船進行精確控制和嚴密監視。
控制中心表示，中午12時56分，在中心科技人員控制下，神舟十一號成功實施首次遠距離導引控制，抬高近地點高度。
北京航天飛行控制中心副總工程師孫軍表示，為牽引太空船追趕萬里之外的太空實驗室「天宮二號」，中心需要對太空船進行5次遠距離導引控制。
首先，中心要抬高太空船的近地點高度，之後對軌道面進行修正，再抬高遠地點高度，最後還要進行軌道圓化和組合體修正。經過5次遠距離導引控制，神舟十一號將到達天宮二號後下方52公里左右的位置。
與前幾次接合任務不同，這次接合軌道和返回軌道高度比之前增加50公里，將首次考驗太空站階段的接合和載人太空船返回技術，還將首次考核太空人中期駐留能力。