總統蔡英文選舉時提出食安五環政策，為了要加強源頭控管，在環境資源部正式成立前，行政院環境保護署在年底前會先成立毒物及化學物質局，編制150人，經費約新台幣6.7億元。
環保署說，化學局為中央三級機關，依照「中央行政組織基準法」第36條規定規定籌設。
主要有8大執掌，包含化學物質登錄政策與法規研擬、執行及監督；毒性化學物質管理政策與法規研擬、執行及督導；毒性化學物質災害防制政策與法規的研擬、執行及監督；環境用藥管理政策與法規的研擬、執行及監督。
化學物質資訊整合分析的應用、協調執行勾稽或檢查事項；毒性化學物質技術研究及發展；化學物質管理國際合作的策劃、推動及協調事項；其他有關毒性化學物質管理事項。