對於兆豐案，蔡英文總統在「執政決策協調會議」中表示，這顯示出政府監理和公股管理的鬆散，不但讓銀行有機會被利用，以及作為洗錢或其他不當交易工具的風險，更造成他國監理機構的不滿與重罰，她認為必須追究責任並檢討。總統府發言人黃重諺轉述：『(原音)本案的處理，必須要：一、追究以往監理/管理疏失的責任；第二、檢討監理/管理機制，嚴格執行與落實金融機構的內部管理，以達到國際標準。』
總統也要求司法機關排除萬難，查明此案有無涉及洗錢，金管會及兆豐則應全力配合，提供所需資料；如果涉及其他國家的管制規定，以致資料取得困難，外交部門也應全力協助，與相關國家展開協商。
同時，總統也要求行政監督小組強化功能，加入外部金融監理專家，檢討監理機制及公股管理。
另外，對於金管會主委丁克華請辭，黃重諺表示，行政院長林全3日上午便向總統報告此事，總統的態度是尊重行政院的相關決定。