泛藍8縣市首長日前登陸行銷觀光後，大陸業者趁勢推出「藍色縣市之旅」的環台旅遊，行程多聚焦在藍營執政縣市，陸方的「藍綠有別」利多，遭質疑是在搞旅遊分化。
台北市長柯文哲2日出席「2016健康物聯網黑客松閉幕式頒獎典禮」受訪時，針對台北市未被列在「藍色縣市之旅」表示，台灣是一體的，除非陸客來台要「跳降落傘」，否則一定得透過綠營執政縣市的機場進出，這種分化手段沒有意義。他說：『(原音)桃園機場是鄭文燦在當市長、清泉崗機場是林佳龍、小港機場是陳菊市長，我就不相信那些大陸客是跳降落傘到台灣。所以台灣是一體的，這個不要想太多。對陸客來講，士林官邸、101、故宮，這些不去，他來台要幹什麼？如果故意要做奇怪的行程，反而也不會有人來。』
柯文哲認為，大陸的手段一定會越來越強烈，但台北市還是會積極爭取陸客；事實上，台北市政府今年初就已組團到東協十國推廣台北旅遊，並推出旅客分散計畫，爭取東協、日韓跟穆斯林國家旅客來台觀光。
另外，由美國、英國主導，針對伊斯蘭國(IS)及其周邊組織發動的「堅定決心」(Inherent Resolve)作戰的官網上，列出參與行動的67個國家及地區，台灣也赫然在列，而且還有國旗以及「Taiwan」字樣。也讓台灣是否會變成恐攻的目標，再度引發關注。不過柯文哲認為，台北市算是對回教最友善的城市，他建議中央在捷運站附近蓋個大一點的清真寺，表達對回教國家友善的態度，他也會向政務委員張景森提出這項建議。